Das Radeln auf dem Radweg neben der Hauptstraße kannst du bei Brouter durch das Setzen von Nogo-Areas vermeiden, allerdings weden da Kreise definiert, mag sein, dass dann eine parallele Nebenstraße auch im Nogo-Area landet.
Vor allem sollte man bei den Einstellungen "Trekking" die Option "ignore cycleroutes" mal ausprobieren.