Hallo!
Für eine Anfahrt nach Tschechien fahre ich gelegentlich mit dem Zug die Strecke München-Passau. Für die Weiterfahrt mit dem Rad nach Budweis gibt es mehrere Varianten, umso weniger Hügel je mehr man die Route ins Österreichische verlegt. Der von "StefanS" gegebene Wiki-Link bietet eine brauchbare Variante mit Zufahrt auf dem Donau-Radweg. (Rechtzeitig richtige Donauseiten wählen.) Er verweist auch auf die kleine Fähre mitten über den Lipno See nach Dolni Vltavice, die in der Saison ab 7 Uhr stündlich für 30 Kc fuhr. Wenn man auf kürzestem Weg nach Budweis will, kann man sie nehmen. Wenn die Fähre nach Dolni V. nicht geht, steht man im (Böhmer) Wald und ist im Sommer den Mücken ausgeliefert. Die Auffahrt von Aigen auf Seeniveau hat auf etwa einem Kilometer ein steiles Stück mit bis zu 8 Prozent, kaum befahren, auch schiebend machbar. Mit GPS bieten sich auch Nebenstrecken an.
Gut und relativ teuer ist der Campingplatz "Villa Bohemia", 3 km vom Fährhafen Dorni Vltavice, mit nicht auf Radler ausgerichteten, landesunüblichen Tarifen. Ich habe mir dort einen Radler-Sondertarif ausgehandelt. Für Eure Anfrage gibt es in diesem Forum noch weitere ergiebige Fundstellen (Suchstellen). Der Fährbetrieb hat keine eigene Internetseite, aber es gibt Fundstellen dazu im Internet.
Die Benutzung der Fähre scheiterte bei uns an nicht vorhandenen tschechischen Kronen. Zwar hätte man auch Euro genommen. Aber der Wechselkurs war so ungünstig, dass wir lieber rund um den See zum Geldautomaten in Lipno fuhren.
Zum "auf dem schnellsten Weg nach Budweis" würde ich nicht raten. Das ist schade drum. Wir haben von Lipno bis Budweis zwei Tage gebraucht. Wegen der vielen schönen Ecken. Im Grunde das netteste Stück Moldau-Radweg.