Ich würde Dir ja mal DEN Standardartikel zum Thema ans Herz legen wollen, auch wenn da das Wort Knie eigentlich kaum mal auftaucht :
ADFC Richtig Sitzen .

Und für die allgemeine Übersicht über das Knie als Weltobjekt und überhaupt ist hier was - aus orthopädischer Sicht - zu finden :
Das Knie als Solches .
Das wird Dir erstmal nicht weiterhelfen, ist aber generell ganz interessant und informativ.

Ich würde erstmal nur auf zu forschen Einstieg tippen. Ansonsten, ersten Artikel lesen und mal über Satteleinstellung und Sattelstütze nachdenken. Die Faustregel vom 'Lot von Knie- durch Pedalachse' und korrekte Sitzhöhe überprüfen.
Auf jeden Fall solltest Du Dich mit dem Gedanken an Barends zur Erweiterung der Griffmöglichkeiten (und damit Belastungswechsel) beschäftigen.

Schönen Gruß, Sebastian

(Edit: Links)